Разработка и апробация стратегии ПЦР-ПДРФ-генотипирования ВБЛ, согласующейся с филогенетической классификацией возбудителя
Руководствуясь принципом совершенствования стратегии ПЦР-ПДРФ-генотипирования, согласующейся с филогенетической классификацией ВБЛ, в ходе системного анализа рестрикционных картирований локуса елу-гена известных представителей ВЬУ, нами были предложены новые условия идентификации по 5 рестриктазам (Руи, &/?1, Нрк, НаеIII и ЯуАН).
Информация с интерпретацией полученных еиу-ПЦР-ПДРФ-профи-лей 422 проанализированных представителей ВЬУ, фактически отражающей стратегию ПЦР-ПДРФ-генотипирования ВБЛ в соответствии с филогенетической классификацией возбудителя, представлена в сводной (табл. 19) и обобщенной (табл. 20) таблицах.
Так, 1-й генотип ВЬУ характеризуется наличием семи комбинаций еяу-ПЦР-ПДРФ-профилей (К 1-7), 2-й генотип - четырех комбинаций (К8-11), 3-й генотип - наличием трех комбинаций (К12-14); 4-й генотип- девяти комбинаций (К15-23); 5-й генотип- трех комбинаций (К24-26); 6-й генотип - двух комбинаций (К27-28), 7-й генотип - четырнадцати комбинаций (К29-42) и 8-й генотип ВБЛ - наличием пяти комбинаций (К43-47) елу-ПЦР-ПДРФ-профилей ВЬУ (табл. 19-20).
Следует отметить, что 8-й генотип ВБЛ может быть успешно идентифицирован даже с использованием одной единственной рестриктазы Нае, генерирующей ПДРФ-фрагменты (225/94/87/32/6 Ьр), характерные только для этих представителей. А с применением двух ферментов могут быть определены представители 2-го (ЛумП и BstY), 3-го (НрИ и НаеШ) и 5-го генотипов (Рум11 и НрМ) ВЬУ.
Примеры реализации стратегии ПЦР-ПДРФ-генотипирования ВБЛ, согласующейся с филогенетической классификацией данного возбудителя представлены на рис. 2-4.
ПЦР-ПДРФ-профиль изолята провируса ВЬУ «N031», запечатленный на электрофореграмме рис. 2 (треки 2-6) позиционируется как 15-я комбинация (К15) елу-ПЦР-ПДРФ-профиля 4-го генотипа ВБЛ, в чей круг входит не менее 115 изолятов (табл. 20), 25 из которых, в части их нуклеотидной последовательности локуса елу-гена, депонированы в вепВапк ИСВ1 нами.
ПЦР-ПДРФ-профиль изолята провируса ВЬУ «N015» (рис. 2, треки 8-12) представляет собой 17-ю комбинацию (К 17) елу-ПЦР-ПДРФ-про-филя 4-го генотипа ВБЛ, насчитывая не менее 17 представителей (табл. 20), в том числе 2 депонированные нами в вепВапк N061 нуклеотидные последовательности локуса е/?у-гена, выявленные на территории Республики Татарстан изоляты возбудителя (изолят «N015», вепВапк АЛЫ: КС867143; изолят «N062», СепВапк АЛЫ: КС886615).
Интерпретация еиг-ПЦР-ПДРФ-профилей представителей ВЬУ в соответствии с филогенетической классификацией
№ п.п. |
Г |
Изолят ВЬУ |
СепВапк лт |
ПЦР- продукт (Ьр) |
ПДРФ-фрагменты (Ьр) |
К |
||||
РгиП |
Sspl |
НрЫ |
Нае III |
|||||||
001 |
1 |
АЬ-63 |
Е3808571 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
1 |
002 |
1 |
АЬ-167 |
Е3808575 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
1 |
003 |
1 |
АЬ-112 |
Е3808572 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
1 |
004 |
1 |
АЬ-220 |
Е1808576 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
1 |
005 |
1 |
ЗРЕН-1 |
ЕЕ065652 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
1 |
006 |
1 |
ЗРА1-2 |
ЕЕ065651 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
1 |
007 |
1 |
ЗРНУ |
ЕЕ065646 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
1 |
008 |
1 |
СЯАС-2 |
ЕЕ065640 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
1 |
009 |
1 |
СЕ08/176/МТ |
JN254640 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
1 |
010 |
1 |
СЕ09/197/8Р |
Ж254636 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
1 |
011 |
1 |
АУ995174 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
1 |
|
012 |
1 |
485 |
АУ151262 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
1 |
013 |
1 |
141 |
АЕ547184 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
1 |
014 |
1 |
РЕ-4315 |
Е3808589 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
1 |
015 |
1 |
ЗРЕН-2 |
ЕЕ065653 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
1 |
016 |
1 |
РЕ-3556 |
Е1808588 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
1 |
017 |
1 |
РЕ-3252 |
Е1808585 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
1 |
018 |
1 |
РЕ-3222 |
Е1808584 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
1 |
019 |
1 |
АЕ-148 |
Е1808573 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
1 |
020 |
1 |
РЕ-3254 |
Е3808586 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
1 |
021 |
1 |
Аиз^аНап |
000647 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
1 |
022 |
1 |
ЕЕК-ВЕУ |
М35242 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
1 |
023 |
1 |
JSIA |
ЕЕ065644 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
1 |
024 |
1 |
шго |
ЕЕ065641 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
1 |
025 |
1 |
РВЕУ913 |
ЕЕ600696 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
1 |
№ п.п. |
Г |
И золят BLV |
Gen Ban к A/N |
ПЦР- продукт (bp) |
ПДРФ-фрагменты (bp) |
К |
||||
Pvull |
Sspl |
Hphl |
Hae III |
BstW |
||||||
026 |
1 |
NB7 |
JQ686110 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
1 |
027 |
1 |
Isfahan |
EU266061 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
1 |
028 |
1 |
Shahrekord |
EU266060 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
1 |
029 |
1 |
Tehran |
EU266063 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
1 |
030 |
1 |
Varamin |
EU266064 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
1 |
031 |
1 |
EU266066 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
1 |
|
032 |
1 |
30 |
AF399703 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
1 |
033 |
1 |
CRAS-3 |
EF065637 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
1 |
034 |
1 |
JPKA-2 |
EF065659 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
1 |
035 |
1 |
JPKA-1 |
EF065658 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
1 |
036 |
1 |
JPAI-1 |
EF065657 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
1 |
037 |
1 |
UruL07IX |
FM955576 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
1 |
038 |
1 |
UruL07VIII |
FM955575 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
1 |
039 |
1 |
UruL07VI |
FM955573 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
1 |
040 |
1 |
UruL07V |
FM955572 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
1 |
041 |
1 |
UruL07II |
FM955570 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
1 |
042 |
1 |
UruL07I |
FM955569 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
1 |
043 |
1 |
UruC06III |
FM955559 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
1 |
044 |
1 |
UruC06I |
FM955557 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
1 |
045 |
1 |
UruLOl VIII |
FM955547 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
1 |
046 |
1 |
UruLOlI |
FM955540 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
1 |
047 |
1 |
UruL07VII |
FM955574 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
1 |
048 |
1 |
UruL07III |
FM955571 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
1 |
049 |
1 |
UruLOl IV |
FM955543 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
1 |
050 |
1 |
USPA |
EF065656 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
1 |
051 |
1 |
468-22 |
AY078387 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
1 |
052 |
1 |
Zanjan |
EU266065 |
444 |
444 |
399/45 |
224 220 |
198 04 87 32 27 6 |
198/128/118 |
1 |
053 |
1 |
USWI |
EF065642 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
1 |
№ п.п. |
И золят BLV |
GenBank A/N |
ПЦР- |
ПДРФ-фрагменты (bp) |
||||||
Г |
продукт (bp) |
Pvull |
Sspl |
Hphl |
Hue III |
BstW |
К |
|||
054 |
1 |
Cow 527 |
AF007764 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
285/94/32/27/6 |
198/128/118 |
2 |
055 |
1 |
K02120 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
285/94/32/27/6 |
198/128/118 |
2 |
|
056 |
1 |
Cow 134 |
AF007763 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
285/94/32/27/6 |
198/128/118 |
2 |
057 |
1 |
JPMI-1 |
EF065660 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
285/94/32/27/6 |
198/128/118 |
2 |
058 |
1 |
Т029 |
AB099344 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
285/94/32/27/6 |
198/128/118 |
2 |
059 |
1 |
IW7 |
AB099338 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
285/94/32/27/6 |
198/128/118 |
2 |
060 |
1 |
JPMI-2 |
EF065661 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
285/94/32/27/6 |
198/128/118 |
2 |
061 |
1 |
JPMI-3 |
EF065662 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
285/94/32/27/6 |
198/128/118 |
2 |
062 |
1 |
23 |
U87873 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
312/94/32/6 |
198/128/118 |
3 |
063 |
1 |
AL-2106 |
FJ808578 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
246/198 |
4 |
064 |
1 |
Urul3 |
FM209475 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
246/198 |
4 |
065 |
1 |
Uru7 |
FM209474 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
246/198 |
4 |
066 |
1 |
Urul8 |
FM209473 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
246/198 |
4 |
067 |
1 |
Uru24 |
FM209472 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
246/198 |
4 |
068 |
1 |
Uru34 |
FM209469 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
246/198 |
4 |
069 |
1 |
UruL002I |
FM955584 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
246/198 |
4 |
070 |
1 |
Uru9JD |
FM955566 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
246/198 |
4 |
071 |
1 |
UrulRl |
FM955563 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
246/198 |
4 |
072 |
1 |
UrullOO |
FM955562 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
246/198 |
4 |
073 |
1 |
UruC06IV |
FM955560 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
246/198 |
4 |
074 |
1 |
UruC05V |
FM955556 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
246/198 |
4 |
075 |
1 |
UruC05III |
FM955554 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
246/198 |
4 |
076 |
1 |
UruL03III |
FM955551 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
246/198 |
4 |
077 |
1 |
UruL03I |
FM955550 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
246/198 |
4 |
078 |
1 |
UruLOIX |
FM955549 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
246/198 |
4 |
079 |
1 |
UruLOlIX |
FM955548 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
246/198 |
4 |
080 |
1 |
UruLOl VII |
FM955546 |
444 |
444 |
399 45 |
224/220 |
19S 94/87/32/27/6 |
246/198 |
4 |
081 |
1 |
UruLO 1 III |
FM955542 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
246/198 |
4 |
ос
№ п.п. |
И золят BLV |
GenBank A/N |
ПЦР- |
ПДРФ-фрагменты (bp) |
||||||
Г |
продукт (bp) |
Pvull |
Sspl |
Hphl |
Hae III |
BstW |
K |
|||
082 |
1 |
UruLOHI |
FM955541 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
246/198 |
4 |
083 |
1 |
UruLOlV |
FM955544 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
246/198 |
4 |
084 |
1 |
UruC05IV |
FM955555 |
444 |
444 |
499/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
246/198 |
4 |
085 |
1 |
UruC05II |
FM955553 |
444 |
444 |
499/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
246/198 |
4 |
086 |
1 |
UruC06VI |
FM955561 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
246/198 |
4 |
087 |
1 |
Uru8JD |
FM955565 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
246/198 |
4 |
088 |
1 |
UrulR2 |
FM955564 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
246/198 |
4 |
089 |
1 |
Uru 11 JD |
FM955568 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
246/198 |
4 |
090 |
1 |
UruC05I |
FM955552 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
246/198 |
4 |
091 |
1 |
UruL09XXI |
FM955583 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
246/198 |
4 |
092 |
1 |
32 |
DQ059418 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
246/198 |
4 |
093 |
1 |
UruLOl VI |
FM955545 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
246/198 |
4 |
094 |
1 |
UruL09XI |
FM955582 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
246/198 |
4 |
095 |
1 |
UruL09VI |
FM955581 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
246/198 |
4 |
096 |
1 |
UruL09I |
FM955577 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
246/198 |
4 |
097 |
1 |
UruL09II |
FM955578 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
246/198 |
4 |
098 |
1 |
Uru 1 JD |
FM955567 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
246/198 |
4 |
099 |
1 |
Uru38 |
FM209471 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
246/198 |
4 |
100 |
1 |
Uru33 |
FM209470 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
246/198 |
4 |
101 |
1 |
UruMC |
FM209468 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
246/198 |
4 |
102 |
1 |
LSI |
HE967301 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
246/198 |
4 |
103 |
1 |
LS2 |
HE967302 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
246/198 |
4 |
104 |
1 |
LS3 |
HE967303 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
246/198 |
4 |
105 |
1 |
UruC06II |
FM955558 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
285/94/32/27/6 |
246/198 |
5 |
106 |
1 |
VdM |
M35239 |
444 |
444 |
399/45 |
224/181/39 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
6 |
107 |
1 |
Kurdistan |
EU266062 |
444 |
444 |
399/45 |
220/196/28 |
198/119/94/27/6 |
198/128/118 |
7 |
108 |
2 |
AL-164 |
FJ808574 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
8 |
109 |
2 |
LS-TSR2 |
FJ808597 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
8 |
№ п.п. |
И золят BLV |
Gen Ban к A/N |
ПЦР- |
ПДРФ-фрагменты (bp) |
||||||
Г |
продукт (bp) |
Pvull |
Sspl |
Hphl |
Hae III |
BstW |
K |
|||
по |
2 |
LS-LS1 |
FJ808594 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
8 |
111 |
2 |
LS-GBA |
FJ808593 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
8 |
112 |
2 |
PL-3371 |
FJ808587 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
8 |
113 |
2 |
PL-1042 |
FJ808581 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
8 |
114 |
2 |
В19 |
AF257515 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
8 |
115 |
2 |
А2771 |
AB099324 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
8 |
116 |
2 |
А2761 |
AB099323 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
8 |
117 |
2 |
А2715 |
AB099321 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
8 |
118 |
2 |
А2368 |
AB099314 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
8 |
119 |
2 |
А2162 |
AB099313 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
8 |
120 |
2 |
А179 |
AB099309 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
8 |
121 |
2 |
А2695 |
AB099318 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
8 |
122 |
2 |
А2697 |
AB099319 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
8 |
123 |
2 |
А22 |
AB099305 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
8 |
124 |
2 |
LS-G2 |
FJ808592 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
8 |
125 |
2 |
LS-Zoo2 |
FJ808598 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
8 |
126 |
2 |
PL9006 |
FJ808591 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
8 |
127 |
2 |
PL-1457 |
FJ808583 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
8 |
128 |
2 |
AL-6114 |
FJ808579 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
8 |
129 |
2 |
A2757 |
AB099322 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
8 |
130 |
2 |
A2613 |
AB099317 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
8 |
131 |
2 |
A2608 |
AB099316 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
8 |
132 |
2 |
A96 |
AB099306 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
8 |
133 |
2 |
A2060 |
AB099312 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
8 |
134 |
2 |
A8086 |
AB099326 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
8 |
135 |
2 |
A2699 |
AB099320 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
8 |
136 |
2 |
A134 |
AB099308 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
19S 94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
8 |
137 |
2 |
A9014 |
AB099327 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
8 |
№ п.п. |
Г |
И золят BLV |
GenBank A/N |
ПЦР- продукт (bp) |
ПДРФ-фрагменты (bp) |
K |
||||
Pvull |
Sspl |
Hphl |
Hue III |
BstW |
||||||
138 |
2 |
А8028 |
AB099325 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
8 |
139 |
2 |
Arg41 |
FJ914764 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
8 |
140 |
2 |
384 |
AF399704 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
8 |
141 |
2 |
PL-247 |
FJ808580 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
8 |
142 |
2 |
PL-4960 |
FJ808590 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/87/49/45/32/27/6 |
198/128/118 |
9 |
143 |
2 |
ARGSF8 |
AF485773 |
444 |
280/164 |
399/45 |
444 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
10 |
144 |
2 |
AL-1453 |
FJ808577 |
444 |
280/164 |
444 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
11 |
145 |
3 |
USCA-1 |
EF065647 |
444 |
444 |
399/45 |
444 |
285/94/32/21/6/6 |
198/128/96/22 |
12 |
146 |
3 |
USCA-2 |
EF065648 |
444 |
444 |
399/45 |
444 |
285/94/32/27/6 |
198/128/96/22 |
13 |
147 |
3 |
USCA-3 |
EF065649 |
444 |
444 |
399/45 |
444 |
285/94/32/27/6 |
198/128/96/22 |
13 |
148 |
3 |
JPFU |
EF065650 |
444 |
444 |
399/45 |
444 |
285/94/32/27/6 |
198/128/118 |
14 |
149 |
4 |
BG |
EF065638 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
150 |
4 |
N10 |
HM102355 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
151 |
4 |
N72 |
JF683619 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
152 |
4 |
4-2 |
HM563781 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
153 |
4 |
N097 |
KC886628 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
154 |
4 |
5Z |
HM563780 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
155 |
4 |
4Z |
HM563779 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
156 |
4 |
5 |
HM563771 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
157 |
4 |
2 |
HM563772 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
158 |
4 |
4 |
HM563770 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
159 |
4 |
1C |
JF720354 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
160 |
4 |
8C |
JF720356 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
161 |
4 |
9C |
JF720357 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
162 |
4 |
1S-C18 |
JQ353648 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
163 |
4 |
1S-C20 |
JQ353647 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
164 |
4 |
1S-C15 |
JQ353641 |
444 |
280 164 |
399/45 |
224 220 |
198 64 87 32 27 6 |
444 |
15 |
165 |
4 |
NV 13 |
JQ686111 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
№ п.п. |
Г |
И золят BLV |
Gen Ban к A/N |
ПЦР- продукт (Ьр) |
ПДРФ-фрагменты (Ьр) |
К |
||||
Pvull |
Sspl |
Hphl |
Нае III |
BstW |
||||||
166 |
4 |
N025 |
КС867150 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
167 |
4 |
N026 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
|
168 |
4 |
N096 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
|
169 |
4 |
1 |
НМ563773 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
170 |
4 |
21 |
U87871 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
171 |
4 |
К02251 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
|
172 |
4 |
AF033818 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
|
173 |
4 |
PL1 |
AF067081 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
174 |
4 |
LB59 |
М35238 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
175 |
4 |
LS-SFB |
FJ808596 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
176 |
4 |
LS-SFA |
FJ808595 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
177 |
4 |
344 |
AF503581 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
178 |
4 |
LB285 |
М35240 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
179 |
4 |
BLVgp-11 |
AF 111171 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
180 |
4 |
27 |
AY515277 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
181 |
4 |
145 |
AY515275 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
182 |
4 |
58 |
AY515278 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
183 |
4 |
96 |
AY515273 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
184 |
4 |
8 |
AY515279 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
185 |
4 |
7С |
JF720355 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
186 |
4 |
1S-C17 |
JQ353644 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
187 |
4 |
lS-сІЗ |
JQ353643 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
188 |
4 |
І8-СІ2 |
JQ353637 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
189 |
4 |
NK4 |
JQ686118 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
190 |
4 |
КА6 |
JQ686096 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
191 |
4 |
КЕ136 |
JQ686095 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
192 |
4 |
1 8 RU |
HQ902262 |
444 |
280 164 |
399/45 |
224 220 |
198 04 87 32 27 6 |
444 |
15 |
193 |
4 |
1 S-c 14 |
JQ353642 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
№ п.п. |
Г |
И золят BLV |
Gen Ban к A/N |
ПЦР- продукт (bp) |
ПДРФ-фрагменты (bp) |
K |
||||
Pvull |
Sspl |
Hphl |
Hae III |
BstW |
||||||
194 |
4 |
NB3 |
JQ686108 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
195 |
4 |
КЕ7 |
JQ686093 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
196 |
4 |
1 4 RU |
HQ902260 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
197 |
4 |
MS9368 |
JQ686100 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
198 |
4 |
MS3630 |
JQ686099 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
199 |
4 |
MS3569 |
JQ686098 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
200 |
4 |
N069 |
КС886619 |
444 |
280.164 |
399.45 |
224.220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
201 |
4 |
N072 |
444 |
280.164 |
399.45 |
224.220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
|
202 |
4 |
4Т-с5 |
JQ353668 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
203 |
4 |
4Т-с6 |
JQ353659 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
204 |
4 |
4Т-с4 |
JQ353669 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
205 |
4 |
4Т-сЗ |
JQ353660 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
206 |
4 |
4Т-с7 |
JQ353657 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
207 |
4 |
MS3566 |
JQ686097 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
208 |
4 |
ЗК |
НМ563782 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
209 |
4 |
6Т |
НМ563783 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
210 |
4 |
МКС5233 |
JQ675758 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
211 |
4 |
КЕ107 |
JQ686094 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
212 |
4 |
МС57 |
JQ686092 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
213 |
4 |
МС45 |
JQ686091 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
214 |
4 |
МС46 |
JQ686090 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
215 |
4 |
МС19 |
JQ686089 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
216 |
4 |
lS-cll |
JQ353646 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
217 |
4 |
R6077 |
JQ686107 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
218 |
4 |
R9884 |
JQ686105 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
219 |
4 |
R6164 |
JQ686104 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
220 |
4 |
NV3 |
JQ686112 |
444 |
280 164 |
399/45 |
224 220 |
198 94 87 32 27 6 |
444 |
15 |
221 |
4 |
R6136 |
JQ686103 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
№ п.п. |
Г |
И золят BLV |
GenBank A/N |
ПЦР- продукт (Ьр) |
ПДРФ-фрагменты (Ьр) |
К |
||||
Pvull |
Sspl |
Hphl |
Hue III |
BstW |
||||||
222 |
4 |
R5070 |
JQ686102 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
223 |
4 |
R5164 |
JQ686106 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
224 |
4 |
R5036 |
JQ686101 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
225 |
4 |
NV14 |
JQ686113 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
226 |
4 |
4Т-с2 |
JQ353666 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
227 |
4 |
1S-C19 |
JQ353639 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
228 |
4 |
N001 |
КС867136 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
229 |
4 |
N002 |
КС867137 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
230 |
4 |
N004 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
|
231 |
4 |
N007 |
КС867141 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
232 |
4 |
N018 |
КС867145 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
233 |
4 |
N019 |
КС867146 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
234 |
4 |
N022 |
КС867148 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
235 |
4 |
N027 |
КС886607 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
236 |
4 |
N033 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
|
237 |
4 |
N031 |
КС886610 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
238 |
4 |
N028 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
|
239 |
4 |
N050 |
КС886613 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
240 |
4 |
N053 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
|
241 |
4 |
N056 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
|
242 |
4 |
N054 |
КС886614 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
243 |
4 |
N074 |
КС886620 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
244 |
4 |
N075 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
|
245 |
4 |
N078 |
КС886621 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
246 |
4 |
N079 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
|
247 |
4 |
N080 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
|
248 |
4 |
N082 |
КС886622 |
444 |
280 164 |
399/45 |
224 220 |
198 04 87 32 27 6 |
444 |
15 |
249 |
4 |
N084 |
КС886623 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
№ п.п. |
Г |
И золят BLV |
GenBank A/N |
ПЦР- продукт (Ьр) |
ПДРФ-фрагменты (Ьр) |
К |
||||
Pvull |
Sspl |
Hphl |
Hue III |
BstW |
||||||
250 |
4 |
N086 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
|
251 |
4 |
N087 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
|
252 |
4 |
N090 |
КС886625 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
253 |
4 |
N110 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
|
254 |
4 |
N111 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
|
255 |
4 |
N113 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
|
256 |
4 |
N114 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
|
257 |
4 |
N124 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
|
258 |
4 |
N092 |
КС886626 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
259 |
4 |
N095 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
|
260 |
4 |
N094 |
КС886627 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
261 |
4 |
N100 |
КС886630 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
262 |
4 |
N122 |
КС886632 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
263 |
4 |
N123 |
КС886633 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
264 |
4 |
3 |
U87872 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
16 |
265 |
4 |
1S-C16 |
JQ353652 |
444 |
280/164 |
399/45 |
444 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
17 |
266 |
4 |
N015 |
КС867143 |
444 |
280/164 |
399/45 |
444 |
198/94/87/32/26/6 |
444 |
17 |
267 |
4 |
N016 |
444 |
280/164 |
399/45 |
444 |
198/94/87/32/26/6 |
444 |
17 |
|
268 |
4 |
N062 |
КС886615 |
444 |
280/164 |
399/45 |
444 |
198/94/87/32/26/6 |
444 |
17 |
269 |
4 |
N127 |
444 |
280/164 |
399/45 |
444 |
198/94/87/32/26/6 |
444 |
17 |
|
270 |
4 |
N128 |
444 |
280/164 |
399/45 |
444 |
198/94/87/32/26/6 |
444 |
17 |
|
271 |
4 |
N129 |
444 |
280/164 |
399/45 |
444 |
198/94/87/32/26/6 |
444 |
17 |
|
272 |
4 |
N130 |
444 |
280/164 |
399/45 |
444 |
198/94/87/32/26/6 |
444 |
17 |
|
273 |
4 |
N131 |
444 |
280/164 |
399/45 |
444 |
198/94/87/32/26/6 |
444 |
17 |
|
274 |
4 |
N132 |
444 |
280/164 |
399/45 |
444 |
198/94/87/32/26/6 |
444 |
17 |
|
275 |
4 |
N134 |
444 |
280/164 |
399/45 |
444 |
198/94/87/32/26/6 |
444 |
17 |
|
276 |
4 |
N136 |
444 |
280 164 |
399/45 |
444 |
198 64 87 32 26 6 |
444 |
17 |
|
277 |
4 |
N137 |
444 |
280/164 |
399/45 |
444 |
198/94/87/32/26/6 |
444 |
17 |
№ п.п. |
И золят BLV |
GenBank A/N |
ПЦР- |
ПДРФ-фрагмепты (bp) |
||||||
Г |
продукт (bp) |
Pvull |
Sspl |
Hphl |
Hue III |
BstW |
К |
|||
278 |
4 |
N138 |
444 |
280/164 |
399/45 |
444 |
198/94/87/32/26/6 |
444 |
17 |
|
279 |
4 |
N139 |
444 |
280/164 |
399/45 |
444 |
198/94/87/32/26/6 |
444 |
17 |
|
280 |
4 |
N140 |
444 |
280/164 |
399/45 |
444 |
198/94/87/32/26/6 |
444 |
17 |
|
281 |
4 |
N023 |
KC867149 |
444 |
280.164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
253/191 |
18 |
282 |
4 |
1 BY |
HQ902258 |
444 |
280/164 |
444 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
19 |
283 |
4 |
2 BY |
HQ902259 |
444 |
280/164 |
444 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
19 |
284 |
4 |
N029 |
KC886608 |
444 |
280/164 |
444 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
19 |
285 |
4 |
N083 |
444 |
280/164 |
444 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
19 |
|
286 |
4 |
N085 |
444 |
280/164 |
444 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
19 |
|
287 |
4 |
N091 |
444 |
280/164 |
444 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
19 |
|
288 |
4 |
N030 |
KC886609 |
444 |
280/164 |
444 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
19 |
289 |
4 |
N034 |
KC886611 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/121/87/32/6 |
444 |
20 |
290 |
4 |
1S-c9 |
JQ353640 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/119/94/27/6 |
444 |
21 |
291 |
4 |
NK11 |
JQ686117 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
285/94/32/27/6 |
444 |
22 |
292 |
4 |
70 |
HM563778 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
285/94/32/27/6 |
444 |
22 |
293 |
4 |
107 |
HM563755 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
285/94/32/27/6 |
444 |
22 |
294 |
4 |
67 |
HM563775 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
285/94/32/27/6 |
444 |
22 |
295 |
4 |
65 |
HM563776 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
285/94/32/27/6 |
444 |
22 |
296 |
4 |
NB12 |
JQ686109 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
285/94/32/27/6 |
444 |
22 |
297 |
4 |
lS-clO |
JQ353650 |
444 |
280/164 |
399/45 |
220/145/79 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
23 |
298 |
5 |
CRAS-1 |
EF065635 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/181/39 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
24 |
399 |
5 |
CRAS-2 |
EF065636 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/181/39 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
24 |
300 |
5 |
CRLC-2 |
EF065654 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/181/39 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
24 |
301 |
5 |
8513 |
AF399702 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/181/39 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
24 |
302 |
5 |
31 |
DQ059416 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/181/39 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
24 |
303 |
5 |
13 |
GQ985390 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/181/39 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
24 |
304 |
5 |
CE09/87/SP |
JN254634 |
444 |
280 164 |
399 45 |
224 181 39 |
19S 94/87/32/27/6 |
316/128 |
24 |
305 |
5 |
CRLV |
EF065643 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/181/39 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
24 |
№ п.п. |
Г |
И золят BLV |
Gen Ban к A/N |
ПЦР- продукт (Ьр) |
ПДРФ-фрагменты (Ьр) |
К |
||||
Pvull |
Sspl |
Hphl |
Нае III |
BstW |
||||||
306 |
5 |
CRGC |
EF065639 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/181/39 |
285/94/32/27/6 |
316/128 |
25 |
307 |
5 |
CRLC-1 |
EF065655 |
444 |
280/164 |
444 |
224/181/39 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
26 |
308 |
5 |
CRAG-1 |
EF065645 |
444 |
280/164 |
444 |
224/181/39 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
26 |
309 |
6 |
PL-1238 |
FJ808582 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
285/94/32/27/6 |
316/128 |
27 |
310 |
6 |
29 |
GQ985391 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
285/94/32/27/6 |
316/128 |
27 |
311 |
6 |
CE09/80/SP |
JN254633 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
285/94/32/27/6 |
316/128 |
27 |
312 |
6 |
СЕ09/196/МТ |
JN254635 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
285/94/32/27/6 |
316/128 |
27 |
313 |
6 |
CE07/04/SP |
JN254637 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
285/94/32/27/6 |
316/128 |
27 |
314 |
6 |
CE09/159/SP |
JN254638 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
285/94/32/27/6 |
316/128 |
27 |
315 |
6 |
34 |
DQ059419 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
285/94/32/27/6 |
316/128 |
27 |
316 |
6 |
151 |
AY185360 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
28 |
317 |
6 |
135 |
AY283061 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
28 |
318 |
6 |
89 |
AY277947 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
28 |
319 |
6 |
50 |
DQ059421 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
28 |
320 |
6 |
2 |
DQ059420 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
28 |
321 |
6 |
25 |
DQ059415 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
28 |
322 |
6 |
10 |
GQ985389 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
28 |
323 |
6 |
СЕ08/180/SP |
JN254639 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
28 |
324 |
7 |
N28 |
НМ102356 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
294/128/22 |
29 |
325 |
7 |
N013 |
КС867142 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
294/128/22 |
29 |
326 |
7 |
N014 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
294/128/22 |
29 |
|
327 |
7 |
N057 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
294/128/22 |
29 |
|
328 |
7 |
N058 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
294/128/22 |
29 |
|
329 |
7 |
N060 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
294/128/22 |
29 |
|
330 |
7 |
N061 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
294/128/22 |
29 |
|
331 |
7 |
176 |
AY515276 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
ЗО |
332 |
7 |
1 |
AY5 15280 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
ЗО |
333 |
7 |
5Т |
НМ563754 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
ЗО |
№ п.п. |
И золят BLV |
Gen Ban к A/N |
ПЦР- |
ПДРФ-фрагменты (Ьр) |
||||||
Г |
продукт (Ьр) |
Pvull |
Sspl |
Hphl |
Нае III |
BstW |
К |
|||
334 |
7 |
4К |
НМ563753 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
ЗО |
335 |
1 |
4 |
НМ563752 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
зо |
336 |
1 |
3 |
НМ563751 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
зо |
337 |
1 |
2S |
JF720350 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
зо |
338 |
1 |
4Т-СІ6 |
JQ353665 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
зо |
339 |
1 |
1S-C5 |
JQ353635 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
зо |
340 |
1 |
NV12 |
JQ686115 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
зо |
341 |
1 |
NV20 |
JQ686116 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
зо |
342 |
1 |
N035 |
КС886612 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
зо |
343 |
1 |
N064 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
зо |
|
344 |
1 |
N081 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
зо |
|
345 |
7 |
N108 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
зо |
|
346 |
7 |
N116 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
зо |
|
347 |
7 |
N118 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
зо |
|
348 |
7 |
N120 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
зо |
|
349 |
7 |
N125 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
зо |
|
350 |
7 |
N133 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
зо |
|
351 |
7 |
4Т |
НМ563757 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
зо |
352 |
7 |
ЗТ |
НМ563756 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
зо |
353 |
7 |
2 |
НМ563750 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
зо |
354 |
7 |
5 |
НМ563749 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
зо |
355 |
7 |
3 |
НМ563748 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
зо |
356 |
7 |
3-1 |
НМ563761 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
зо |
357 |
7 |
3-3 |
НМ563760 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
зо |
358 |
7 |
3-18 |
НМ563759 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
зо |
359 |
7 |
3-15 |
НМ563758 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
зо |
360 |
7 |
160 |
НМ563763 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
19S 94/87/32/27/6 |
316/128 |
зо |
361 |
7 |
I 7 RU |
HQ902261 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
зо |
№ п.п. |
И золят BLV |
GenBank A/N |
ПЦР- |
ПДРФ-фрагменты (Ьр) |
||||||
Г |
продукт (Ьр) |
Pvull |
Sspl |
Hphl |
Hue III |
BstW |
К |
|||
362 |
7 |
4Т-СІ4 |
JQ353671 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
30 |
363 |
1 |
4Т-СІ7 |
JQ353664 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
30 |
364 |
1 |
4Т-СІ8 |
JQ353667 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
30 |
365 |
1 |
1S-C8 |
JQ353636 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
30 |
366 |
1 |
МКС3877 |
JQ675756 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
30 |
367 |
1 |
NK13 |
JQ686119 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
30 |
368 |
1 |
1S-C2 |
JQ353638 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
30 |
369 |
1 |
4Т-СІ5 |
JQ353653 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
30 |
370 |
1 |
4Т-СІЗ |
JQ353654 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
30 |
371 |
1 |
МКС626 |
JQ675757 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
30 |
372 |
1 |
N003 |
КС867138 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
30 |
373 |
7 |
N008 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
30 |
|
374 |
7 |
N005 |
КС867139 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
30 |
375 |
7 |
N017 |
КС867144 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
30 |
376 |
7 |
N021 |
КС867147 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
30 |
377 |
7 |
N066 |
КС886617 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
30 |
378 |
7 |
N099 |
КС886629 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
30 |
379 |
7 |
N101 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
30 |
|
380 |
7 |
N102 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
30 |
|
381 |
7 |
N104 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
30 |
|
382 |
7 |
N105 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
30 |
|
383 |
7 |
N106 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
30 |
|
384 |
7 |
12 |
S83530 |
444 |
444 |
444 |
224/220 |
285/94/32/27/6 |
316/128 |
31 |
385 |
7 |
14 |
AY515274 |
444 |
444 |
444 |
145/137/83/79 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
32 |
386 |
7 |
30 |
DQ059417 |
444 |
444 |
444 |
444 |
198/87/49/45/32/27/6 |
316/128 |
33 |
387 |
7 |
3S |
JF720351 |
444 |
280/164 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
34 |
388 |
7 |
5S |
JF720353 |
444 |
280 164 |
444 |
224/137/83 |
19S 94/87/32/27/6 |
316/128 |
34 |
389 |
7 |
lS-сЗ |
JQ353645 |
444 |
280/164 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
34 |
№ п.п. |
Г |
И золят BLV |
GenBank A/N |
ПЦР- продукт (bp) |
ПДРФ-фрагменты (bp) |
K |
||||
Pvull |
Sspl |
Hphl |
Hue III |
BstW |
||||||
390 |
7 |
4Т-СІ9 |
JQ353655 |
444 |
444 |
399/45 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
35 |
391 |
7 |
4Т-С20 |
JQ353661 |
444 |
444 |
399/45 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
35 |
392 |
7 |
4Т-с21 |
JQ353663 |
444 |
444 |
399/45 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
35 |
393 |
7 |
1S-C4 |
JQ353651 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
316/79/49 |
36 |
394 |
7 |
NK17 |
JQ686120 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/87/49/45/32/27/6 |
316/128 |
37 |
395 |
7 |
4Т-СІ2 |
JQ353662 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/87/49/45/32/27/6 |
316/128 |
37 |
396 |
7 |
4S |
JF720352 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/119/94/27/6 |
316/128 |
38 |
397 |
7 |
IS-сб |
JQ353633 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/121/87/32/6 |
316/128 |
39 |
398 |
7 |
4Т-СІ1 |
JQ353656 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
285/94/32/27/6 |
316/128 |
40 |
399 |
7 |
N067 |
KC886618 |
444 |
444 |
444 |
224/137/44/39 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
41 |
400 |
7 |
lS-cl |
JQ353649 |
444 |
444 |
444 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
42 |
401 |
7 |
4Т-с1 |
JQ353658 |
444 |
444 |
444 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
42 |
411 |
8 |
M1/ELG Сго/08 |
GU724606 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
225/94/87/32/6 |
198/128/118 |
43 |
412 |
8 |
ELG Сго/ВЕМ/08 |
JN990069 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
225/94/87/32/6 |
198/128/118 |
43 |
413 |
8 |
ELG Сго/ОSА/08 |
JN990070 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
225/94/87/32/6 |
198/128/118 |
43 |
414 |
8 |
ELG Cro/MIT/09 |
JN990073 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
225/94/87/32/6 |
198/128/118 |
43 |
415 |
8 |
ELG Cro/ORA/09 |
JN990071 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
225/94/87/32/6 |
198/128/118 |
43 |
406 |
8 |
3-43 |
HM563767 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
225/94/87/32/6 |
198/128/118 |
43 |
407 |
8 |
4-1 |
HM563766 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
225/94/87/32/6 |
198/128/118 |
43 |
408 |
8 |
N063 |
KC886616 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
225/94/87/32/6 |
198/128/118 |
43 |
409 |
8 |
N068 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
225/94/87/32/6 |
198/128/118 |
43 |
|
410 |
8 |
2-48 |
HM563768 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
225/94/87/32/6 |
198/128/118 |
43 |
416 |
8 |
N006 |
KC867140 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
225/94/87/32/6 |
198/128/118 |
43 |
417 |
8 |
N009 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
225/94/87/32/6 |
198/128/118 |
43 |
|
418 |
8 |
N089 |
KC886624 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
225/94/87/32/6 |
198/128/118 |
43 |
402 |
8 |
N174 |
JF713455 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
225/94/87/32/6 |
316/128 |
44 |
403 |
8 |
МКС3511 |
JQ675760 |
444 |
444 |
399 45 |
224/220 |
225/94/87/32/6 |
316/128 |
44 |
404 |
8 |
N121 |
KC886631 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
225/94/87/32/6 |
316/128 |
44 |
№ п.п. |
Г |
И золят BLV |
Gen Ban к A/N |
ПЦР- продукт (Ьр) |
ПДРФ-фрагменты (Ьр) |
К |
||||
Pvull |
Sspl |
Hphl |
Нае III |
BstW |
||||||
405 |
8 |
N142 |
КС886634 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
225/94/87/32/6 |
316/128 |
44 |
419 |
8 |
ELG Cro/VRA/09 |
JN990072 |
444 |
444 |
444 |
224/220 |
225/94/87/32/6 |
198/128/118 |
45 |
420 |
8 |
ELG Сго/ВЮ/10 |
JN990074 |
444 |
444 |
444 |
224/220 |
225/94/87/32/6 |
198/128/118 |
45 |
421 |
8 |
4-6 |
НМ563764 |
444 |
444 |
399/45 |
224/137/83 |
225/94/87/32/6 |
198/128/118 |
46 |
422 |
8 |
МКС2137 |
JQ675759 |
444 |
444 |
399/45 |
444 |
225/94/87/32/6 |
198/128/118 |
47 |
Обозначения: Г - генотип; К - комбинация.
Стратегия ПЦР-ПДРФ-генотипирования BLV, разработанная в соответствии с филогенетической классификацией возбудителя
Л'# 9/1 П О Iff |
K/f И I/ |
ПЦР- |
ПДРФ-фрагменты (bp) |
|||||||
Г |
BLV |
A/N |
продукт (bp) |
Pvull |
Sspl |
Hphl |
Hae III |
BstW |
К |
N |
1 |
AL-63 |
FJ808571 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
1 |
53 |
1 |
Cow 527 |
AF007764 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
285/94/32/27/6 |
198/128/118 |
2 |
8 |
1 |
23 |
U87873 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
312/94/32/6 |
198/128/118 |
3 |
1 |
1 |
AL-2106 |
FJ808578 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
246/198 |
4 |
42 |
1 |
UruC06II |
FM955558 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
285/94/32/27/6 |
246/198 |
5 |
1 |
1 |
VdM |
M35239 |
444 |
444 |
399/45 |
224/181/39 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
6 |
1 |
1 |
Kurdistan |
EU266062 |
444 |
444 |
399/45 |
220/196/28 |
198/119/94/27/6 |
198/128/118 |
7 |
1 |
2 |
AL-164 |
FJ808574 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
8 |
34 |
2 |
PL-4960 |
FJ808590 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/87/49/45/32/27/6 |
198/128/118 |
9 |
1 |
2 |
ARGSF8 |
AF485773 |
444 |
280/164 |
399/45 |
444 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
10 |
1 |
2 |
AL-1453 |
FJ808577 |
444 |
280/164 |
444 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
198/128/118 |
11 |
1 |
3 |
USCA-1 |
EF065647 |
444 |
444 |
399/45 |
444 |
285/94/32/21/6/6 |
198/128/96/22 |
12 |
1 |
3 |
USCA-2 |
EF065648 |
444 |
444 |
399/45 |
444 |
285/94/32/27/6 |
198/128/96/22 |
13 |
2 |
3 |
JPFU |
EF065650 |
444 |
444 |
399/45 |
444 |
285/94/32/27/6 |
198/128/118 |
14 |
1 |
4 |
BG |
EF065638 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
115 |
4 |
3 |
U87872 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
16 |
1 |
4 |
1S-C16 |
JQ353652 |
444 |
280/164 |
399/45 |
444 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
17 |
16 |
4 |
N023 |
KC867149 |
444 |
280.164 |
399.45 |
224.220 |
198/94/87/32/27/6 |
253/191 |
18 |
1 |
4 |
1 BY |
HQ902258 |
444 |
280/164 |
444 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
19 |
7 |
4 |
N034 |
KC886611 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/121/87/32/6 |
444 |
20 |
1 |
4 |
1S-c9 |
JQ353640 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/119/94/27/6 |
444 |
21 |
1 |
4 |
NK11 |
JQ686117 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
285/94/32/27/6 |
444 |
22 |
6 |
4 |
lS-clO |
JQ353650 |
444 |
280/164 |
399/45 |
220/145/79 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
23 |
1 |
5 |
CRAS-1 |
EF065635 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/181/39 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
24 |
8 |
5 |
анзс |
ЕЕ065639 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/181/39 |
285/94/32/27/6 |
316/128 |
25 |
1 |
5 |
СЯЬС-1 |
ЕЕ065655 |
444 |
280/164 |
444 |
224/181/39 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
26 |
2 |
6 |
РЬ-1238 |
Е3808582 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
285/94/32/27/6 |
316/128 |
27 |
7 |
6 |
151 |
АУ185360 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
28 |
8 |
7 |
N28 |
НМ102356 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
294/128/22 |
29 |
7 |
7 |
176 |
АУ515276 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
30 |
53 |
7 |
12 |
883530 |
444 |
444 |
444 |
224/220 |
285/94/32/27/6 |
316/128 |
31 |
1 |
7 |
14 |
АУ515274 |
444 |
444 |
444 |
145/137/83/79 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
32 |
1 |
7 |
30 |
ОО059417 |
444 |
444 |
444 |
444 |
198/87/49/45/32/27/6 |
316/128 |
33 |
1 |
7 |
38 |
№720351 |
444 |
280/164 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
34 |
3 |
7 |
4Т-с19 |
10353655 |
444 |
444 |
399/45 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
35 |
3 |
7 |
18-о4 |
10353651 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
316/79/49 |
36 |
1 |
7 |
N107 |
10686120 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/87/49/45/32/27/6 |
316/128 |
37 |
2 |
7 |
48 |
№720352 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/119/94/27/6 |
316/128 |
38 |
1 |
7 |
18-сб |
30353633 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/121/87/32/6 |
316/128 |
39 |
1 |
7 |
4Т-с11 |
30353656 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
285/94/32/27/6 |
316/128 |
40 |
1 |
7 |
N067 |
КС886618 |
444 |
444 |
444 |
224/137/44/39 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
41 |
1 |
7 |
18-с1 |
30353649 |
444 |
444 |
444 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
42 |
2 |
8 |
М1/ЕЬС Сго/0 8 |
ОШ24606 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
225/94/87/32/6 |
198/128/118 |
43 |
13 |
8 |
N174 |
ЗЕ713455 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
225/94/87/32/6 |
316/128 |
44 |
4 |
8 |
ЕЬС Сго/УЯА/09 |
3^90072 |
444 |
444 |
444 |
224/220 |
225/94/87/32/6 |
198/128/118 |
45 |
2 |
8 |
4-6 |
НМ563764 |
444 |
444 |
399/45 |
224/137/83 |
225/94/87/32/6 |
198/128/118 |
46 |
1 |
8 |
МКС2137 |
30675759 |
444 |
444 |
399/45 |
444 |
225/94/87/32/6 |
198/128/118 |
47 |
1 |
Обозначения: Г— генотип; К - комбинация; N - количество проанализированных изолятов ВЬУ с соответствующей комбинацией ПЦР-ПДРФ-нрофилей.
ПЦР-ПДРФ-профиль изолята провируса ВЬУ «N023» (рис. 2, треки 14-18) относится к 18-й комбинации (К18) епу-ПЦР-ПДРФ-профиля 4-го генотипа, с пока единственно насчитываемой (для данной комбинации) и депонированной нами в вепВапк ИСВ1 нуклеотидной последовательностью локуса еяу-гена возбудителя (изолят «N023», ОепВапк А/№ КС867149).
ПЦР-ПДРФ-профиль изолята провируса ВЬУ «N029», запечатленный на рис. 3 (треки 2-6) позиционируется как 19-я комбинация (К 19) елу-ПЦР-ПДРФ-профиля 4-го генотипа ВБЛ, в чей круг входят не менее 7 изолятов (табл. 20), 5 из которых выявлены нами на территории РТ.
ПЦР-ПДРФ-профиль изолята провируса ВЬУ «N034» (рис. 3, треки 8-12) относится к 20-й комбинации (К20) епу-ПЦР-ПДРФ-профиля 4-го генотипа, с пока единственно насчитываемой (для данной комбинации) и депонированной нами в вепВапк N061 нуклеотидной последовательностью локуса епу-гена возбудителя (изолят «N034», ОепВапк А/№ КС886611).
ПЦР-ПДРФ-профиль изолята провируса ВЬУ «N013» (рис. 3, треки 14-18) представляет собой 29-ю комбинацию (К) еяу-ПЦР-ПДРФ-про-филя 7-го генотипа ВБЛ, насчитывая не менее 7 представителей (табл. 20), в том числе 2 депонированные нами в ОепВапк N061 нуклеотидные последовательности локуса еяу-гена выявленных на территории Республики Татарстан изолятов возбудителя (изолят «N28», ОепВапк А/№ НМ102356; изолят «N013», ОепВапк А/№ КС867142).
Электрофореграмма ПЦР-ПДРФ-профилей выявленных нами изолятов провируса ВЬУ: «N067 (41-я комбинация 7-го генотипа ВБЛ), «N006» и «N142» (43-я и 44-я комбинации 8-го генотипа) запечатлена на рис. 4.
Результат моделирования рестриктограмм по 5 эндонуклеазам рестрикции (РуыП, &/?1, НрМ, НаеIII и В${У1) с характерными для определенного генотипа ВЬУ комбинациями еиу-ПЦР-ПДРФ-профилей представлен на рис. 5.1-5.6.
Достоверность т зШсо моделирования рестриктограмм обоснована данными результатов выравнивания и рестрикционного картирования (схема Ы-1.13).
А сводные данные результатов апробации разработанной стратегии генотипирования на 100 выявленных нами изолятах ВЬУ представлены в табл. 21.
- 444 Ьр 399 Ьр
- 100 Ьр 50 Ьр

- 94/87 Ьр
- 45 Ьр
- 32 Ьр 27 Ьр
Рис. 2. Электрофореграмма ПЦР-ПДРФ-профилей изолятов провируса ВЬУ «N031», «N015» и «N023» (предложенная стратегия генотипирования ВЬУ)
- 1000 Ьр
- 700 Ьр
- 500 Ьр 400 Ьр
- 300 Ьр 200 Ьр
- 280 Ьр 253 Ьр
- 224/220 Ьр 198/191 Ьр 164 Ьр
Обозначения: 1, 7, 13) ДНК-маркеры 100 Ьр + 50 Ьр (СибЭнзим). 2-6) ПЦР-ПДРФ-профиль изолята провируса ВЬУ «N031» (К15, 4-й генотип): 2) АлЛІ-ПДРФ (280/164 Ьр); 3) &/Л-ПДРФ (399/45 Ьр); 4) НркІ-ПДРФ (224/220 Ьр); 5) ЯаеШ-ПДРФ (198/94/87/32/27/6 Ьр); 6) в^УІ-ПДРФ (444 Ьр). 8—12) ПЦР-ПДРФ-профиль изолята провируса ВЬУ «N015» (К17, 4-й генотип): 8) АлЛІ-ПДРФ (280/164 Ьр); 9) &/Л-ПДРФ (399/45 Ьр); 10) НріЛ-ПДРФ (444 Ьр); 11) Нае 1ІІ-ПДРФ (198/94/87/32/27/6 Ьр); 12) &?У1-ПДРФ (444 Ьр). 14-18) ПЦР-ПДРФ-профиль изолята провируса ВЬУ «N023» (К18, 4-й генотип): 14) РгиП-ПДРФ (280.164 Ьр); 15) 5^1-ПДРФ (399/45 Ьр); 16) НркІ-ПДРФ (224/220 Ьр); 17) ЯаеШ-ПДРФ (198/94/87/32/27/6 Ьр); 18) 55/УІ-ПДРФ (253/191 Ьр).
- 444 Ьр 399 Ьр
- 100 Ьр
- 50 Ьр

Рис. 3. Электрофореграмма ПЦР-ПДРФ-профилей изолятов провируса ВЬУ «N029», «N034» и «N013» (предложенная стратегия генотипирования ВЬУ)
- 1000 Ьр 700 Ьр
- 500 Ьр 400 Ьр
- 300 Ьр 200 Ьр
- 294 Ьр 280 Ьр 224/220 Ьр 198 Ьр
- 164 Ьр
- 137/128 Ьр 121 Ьр
- 94/87 Ьр 83 Ьр 1

Обозначения: 1, 7, 13) ДНК-маркеры 100 Ьр + 50 Ьр (СибЭнзим). 2-6) ПЦР-ПДРФ-профиль изолята провируса ВЬУ «N029» (К19, 4-й генотип): 2) Руміі-ПДРФ (280/164 Ьр); 3) %?1-ПДРФ (444 Ьр); 4) Нрк-ПДРФ (224/220 Ьр); 5) ЯаеШ-ПДРФ (198/94/87/32/27/6 Ьр); 6) РяУІ-ПДРФ (444 Ьр). 8-12) ПЦР-ПДРФ-профиль изолята провируса ВЬУ «N034» (К20, 4-й генотип): 8) Руміі-ПДРФ (280/164 Ьр); 9) &/Л-ПДРФ (399/45 Ьр); 10) Я/У?1-ПДРФ (224/220 Ьр); 11) ЯмеШ-ПДРФ (198/121/87/32/6 Ьр); 12) Рл'ЛЧ-ПДРФ (444 Ьр). 14-18) ПЦР-ПДРФ-ирофиль изолята провируса ВЬУ «N013» (К29, 7-й генотип): 14) Руміі-ПДРФ (444 Ьр); 15) &/Л-ПДРФ (444 Ьр); 16) ЯрЛІ-ПДРФ (224/137/83 Ьр); 17) ЯаеШ-ПДРФ (198/94/87/32/27/6 Ьр); 18) Р5/УІ-ПДРФ (294/128/22 Ьр).
- 1000 Ьр
- 700 Ьр
- 500 Ьр 400 Ьр

- 300 Ьр
- 200 Ьр
- 100 Ьр 50 Ьр

Рис. 4. Электрофореграмма ПЦР-ПДРФ-профилей изолятов провируса ВЬУ «N067», «N006» и «N142» (предложенная стратегия генотипирования ВЬУ)

- 444 Ьр 399 Ьр
- 316 Ьр
- 225/224/220 Ьр 198 Ьр
- 137/128 Ьр 118 Ьр 94/87 Ьр
- 45/44/39 Ьр 32/27 Ьр
Обозначения: 1, 7, 13) ДНК-маркеры 100 Ьр + 50 Ьр (СибЭнзим). 2-6) ПЦР-ПДРФ-профиль изолята провируса ВЬУ «N067» (К41, 7-й генотип): 2) Ргг/Я-ПДРФ (444 Ьр); 3) &/У-ПДРФ (444 Ьр); 4) НрЫ-ПДРФ (224/137/44/39 Ьр); 5) ЯаеШ-ПДРФ (198/94/87/32/27/6 Ьр); 6) ЯУУІ-ПДРФ (316/128 Ьр). 8-12) ПЦР-ПДРФ-профиль изолята провируса ВЬУ «N006» (К43, 8-й генотип): 8) РшІІ-ПДРФ (444 Ьр); 9) &/Л-ПДРФ (399/45 Ьр); 10) Нр/гі-ПДРФ (224/220 Ьр); 11) ЯаеШ-ПДРФ (225/94/87/32/6 Ьр); 12) ^/УІ-ПДРФ (198/128/118 Ьр). 14—18) ПЦР-ПДРФ-профиль изолята провируса ВЬУ «N142» (К44, 8-й генотип): 14) ТУмІІ-ПДРФ (444 Ьр); 15) &р1-ПДРФ (399/45 Ьр); 16) Нрк-ПДРФ (224/220 Ьр); 17) ЯаеШ-ПДРФ (225/94/87/32/6 Ьр); 18) ВяГУІ-ПДРФ (316/128 Ьр).
о
- 500 -
- 100 -
- 1000 -
- 500 -
- 100 -
- 12 3 4
Сепоіуре 1 Сепоіуре 1 Єепоіуре 1 Сепоіуре 1
пагкег РуиІІ 8грІ НрЫ НаеІІІ ВгіУІ РліІІ 8хр1 Ц)Ы НаеІІІ ВгіУІ Ручіі ЗгрІ НрЫ НаеІІІ В$іУІ РліІІ 8хрІ ^)Ы НаеІІІ ВгіУІ пагкег
- — — - 500
- - 100
- 7 1000
- - 500
- - 100
5 |
6 |
7 |
8 |
Сепоіуре 1 |
Сепоіуре 1 |
Сепоіуре 1 |
Сепоіуре 2 |
пагкег РуиІІ 8грІ НрЫ НаеІІІ ВгіУІ |
РгаІІ $$фІ НрЫ НаеІІІ ВгіУІ |
Рупії 8брі НрЫ НаеІІІ ВгіУІ |
Рупії 8грІ І^ІіІ НаеІІІ ВгіУІ пагкег |
- 500 -
- 100 -
- - 500 •
- - 100 •
- 13 14 15 16
Genotype 3 Genotype 3 Genotype 4 Genotype 4
narker PvuII SspI HphI Haelll BstYI PvuII SspI HphI HaelH BstYI PvuII SspI HphI Haelll BstYI PvuII SspI HphI HaelH BstYI narker
- 1000 -
- 500 -
- 100 -
г 1000
- - 500 •
- - 100 •
- 500 -
- 100 -
- — — - 500 •
- - 100 •
21 |
22 |
23 |
24 |
Genotype 4 |
Genotype 4 |
Genotype 4 |
Genotype 5 |
narker PvuII SspI HphI Haelll BstYI |
PvuII SspI HphI Haelll BstYI |
PvuII SspI HphI Haelll BstYI |
Pv'uII SspI HphI Haelll BstYI narker |
- 1000 -
- 500 -
- 100 -
Г 1000
- - 500 •
- - 100 •
- 500 -
- 100 -
- — — - 500 •
- - 100 •
29 |
30 |
31 |
32 |
СетНуре 7 |
Сепо1уре 7 |
СешИуре 7 |
Сепо1уре 7 |
«агкег РшН йяр! 4)Ы НаеШ В*1У1 |
РтоИ 8$ф1 НрЫ НаеШ В51У1 |
РуиП 8Бр1 Ц)Ы НаеШ Вг1У1 |
РуиП НаеШ В*1У1 «агкег |
- 1000 -
- 500 -
- 100 -
Г 1000
- - 500 •
- - 100 •
- 500 -
- 100 -
- - - г 1000
- — - 500 •
- - 100 •
37 |
3S |
39 |
40 |
Genotype 7 |
Genotype 7 |
Genotype 7 |
Genotype 7 |
narker Pv-uII SspI HphI Haelll BstYI |
Pv-uII SspI HphI Haelll BstYI |
PvuII SspI HphI Haelll BstYI |
PvuII SspI HphI Haelll BstYI narker |
- 1000 -
- 500 -
- 100 -
г 1000
- - 500 •
- - 100 •
- 41 42 43 44
Сепофре 7 СешНуре 7 ОпсПуре 8 СетКуре 8
пагкег Рш11 8 яр! ^)Ы НаеШ В*1У1 РгоП 8гр1 НрЫ НаеШ В*1У1 РгиП 8гр1 НрЫ НаеШ В$1У1 РтиН 8хр! Ц)Ы НаеШ В*1У1 пагкег
- 500 -
- 100 -
- - 500 •
- -100 •
СешИуре 8
Рто11 8$ф1 НрЫ НаеШ В51У1
О шНуре 8
«агкег РуиН йБр! 4)Ы НаеШ В*1У1
СешИуре 8
РгаП 8Бр1 Ц)Ы НаеШ В*1У1 «агкег
О
ЧО
- 1000 -
- 500 -
- 100 -
г юоо
- - 500 •
- - 100 •
Изолят BLV AL-63 Cow 527 23
AL-2106
UruC06II
VdM
Kurdistan
AL-164
PL-4960
ARGSF8
AL-1453
USCA-1
USCA-2
JPFU
BG
1S-C16
N023
1_BY
N034
1S-c9
NK11
lS-clO
CRAS-1
CRGC
CRLC-1
PL-1238
151
N28
- 12
- 30
- 3S
- 4T-cl9
- 1S-c4
NK17
- 4S
- 1S-c6
- 4T-cll
N067
lS-cl
ELG_Cro/08
N174
Cro/VRA/09
4-6
MKC2137
- 001
- 001
- 001
- 001
- 001
- 001
- 001
- 001
- 001
- 001
- 001
- 001
- 001
- 001
- 001
- 001
- 001
- 001
- 001
- 001
- 001
- 001
- 001
Праймер «env5099»_
CCCACAAGGGCGGCGCCGGTTT Haelll
CCCACAAGGGCGGCGCCGGTTTGGAGCCAGGGCCATGGTCACATATGATT
A

A
A
A
T

? ?? ?????? ????? ?? ??????? ? ieie ? ??????????
AL-63 |
051 |
Cow 527 |
051 |
23 |
051 |
AL-2106 |
051 |
UruC06lI |
051 |
VdM |
051 |
Kurdistan |
051 |
AL-164 |
051 |
PL-4960 |
051 |
ARGSF8 |
051 |
AL-1453 |
051 |
USCA-1 |
051 |
USCA-2 |
051 |
JPFU |
051 |
BG |
051 |
3 |
051 |
1S-C16 |
051 |
N023 |
051 |
1_BY |
051 |
N034 |
051 |
1S-c9 |
051 |
NK11 |
051 |
lS-clO |
051 |
CRAS-1 |
051 |
CRGC |
051 |
CRLC-1 |
051 |
PL-1238 |
051 |
151 |
051 |
N28 |
051 |
176 |
051 |
12 |
051 |
14 |
051 |
30 |
051 |
3S |
051 |
4T-cl9 |
051 |
1S-C4 |
051 |
NK17 |
051 |
4S |
051 |
1S-c6 |
051 |
4T-cll |
051 |
N067 |
051 |
lS-cl |
051 |
ELG Cro/08 |
051 |
N174 |
051 |
Cro/VRA/09 |
051 |
4-6 |
051 |
MKC2137 |
051 |
GCGAGCCCCGATGCCCTTATGTGGGGGCAGATCGCTTCGACTGCCCCCAC
..................................G...............
A
A
A
A
A
A
A
A
A
T
A
?????????? ????? ?? ????? ??????? ????? ?? ??????
Изолят BLV |
|
AL-63 |
101 |
Cow 527 |
101 |
23 |
101 |
AL-2106 |
101 |
UruCO?II |
101 |
VdM |
101 |
Kurdistan |
101 |
AL-164 |
101 |
PL-4960 |
101 |
ARGSF8 |
101 |
AL-1453 |
101 |
USCA-1 |
101 |
USCA-2 |
101 |
JPFU |
101 |
BG |
101 |
3 |
101 |
1S-C16 |
101 |
N023 |
101 |
1 BY |
101 |
N034 |
101 |
1S-c9 |
101 |
NK11 |
101 |
lS-clO |
101 |
CRAS-1 |
101 |
CRGC |
101 |
CRLC-1 |
101 |
PL-1238 |
101 |
151 |
101 |
N28 |
101 |
176 |
101 |
12 |
101 |
14 |
101 |
30 |
101 |
3S |
101 |
4T-cl9 |
101 |
1S-C4 |
101 |
NK17 |
101 |
4S |
101 |
1S-c6 |
101 |
4T-cll |
101 |
N067 |
101 |
lS-cl |
101 |
ELG Cro/08 |
101 |
N174 |
101 |
Cro/VRA/09 |
101 |
4-6 |
101 |
MKC2137 |
101 |
HaelII
B s tYI
Hphl.
101 TGGGACAATGCCTCCCAGGCCGATC6AGGATCCTTTTATGTCAATCATCA
.A........................
.A........................
.A.'
.A.
. A. _
.ag‘
.A."
.a/
.A."
.A.’
.A.’
.A."
.A.’
.A.’
.A.
.A.
.A.
.A.
.A.
.A.
.A.
.A.
. A. _
.A."
.A."
T. A
T
T
A
A
A
T
G
G
G
G
G
G
G
G
G
G
G
G
G
G
G
G
C
C
C
G.A G. .
AT.... AG
____AG'
_______a/
____A/
.T____A."
_______A.‘
___. . . .A/
____A/
____A/
____A/
____A/
____A/
____A/
T.....A.'
_______A.'
____A/
____A. _
____AG^
____A/
____A/
......A.'
BsfcYI Hphl_
Изолят BLV |
|
AL-63 |
151 |
Cow 527 |
151 |
23 |
151 |
AL-2106 |
151 |
UruCO?II |
151 |
VdM |
151 |
Kurdistan |
151 |
AL-164 |
151 |
PL-4960 |
151 |
ARGSF8 |
151 |
AL-1453 |
151 |
USCA-1 |
151 |
USCA-2 |
151 |
JPFU |
151 |
BG |
151 |
3 |
151 |
1S-C16 |
151 |
N023 |
151 |
1 BY |
151 |
N034 |
151 |
1S-c9 |
151 |
NK11 |
151 |
lS-clO |
151 |
CRAS-1 |
151 |
CRGC |
151 |
CRLC-1 |
151 |
PL-1238 |
151 |
151 |
151 |
N28 |
151 |
176 |
151 |
12 |
151 |
14 |
151 |
30 |
151 |
3S |
151 |
4T-cl9 |
151 |
1S-C4 |
151 |
NK17 |
151 |
4S |
151 |
1S-c6 |
151 |
4T-cll |
151 |
N067 |
151 |
lS-cl |
151 |
ELG Cro/08 |
151 |
N174 |
151 |
Cro/VRA/09 |
151 |
4-6 |
151 |
MKC2137 |
151 |
..........A..........G
C.....................
c.....................
c.....................
GATTTTATTCCTGCATCTCAAACAATGTCATGGAATTTTCACTCTAACCT
C..................................
c..................................
..................................c
........................................T
........................................T
........................................T
........................................T
.......................................
.......................................
......T..................................
c
T
G
C. .G

C.......T
.C. . . .C....................................G. . . .
...........................................G. . ..
.............G..................................
...........................................G. . ..
..........A.....T.............................T.
...........................................G. . . .
...........................................G. . . .
...........................................G. . . .
...........................................G.. ..
...........................................G. . ..
...........................................G. . ..
...........................................G. . ..
........................................C.......
C...............................................
Изолят BLV |
Hphl |
BstYI |
|||
AL-63 |
201 |
GGGAGATATGGGGATATGATCCCCTGATCACCTTTTCTTTACATAAGATC |
|||
Cow 527 |
201 |
||||
23 |
201 |
||||
AL-2106 |
201 |
||||
UruCO?II |
201 |
||||
VdM |
201 |
..........T |
|||
Kurdistan |
201 |
........AA. . . |
. . .C......... |
||
AL-164 |
201 |
. . . .A........ |
......c...... |
||
PL-4960 |
201 |
. . . .A........ |
......c...... |
||
ARGSF8 |
201 |
. . . .A........ |
......c...... |
.c........... |
|
AL-1453 |
201 |
. . . .A........ |
......c...... |
||
USCA-1 |
201 |
. . . .A........ |
.....G....... |
||
USCA-2 |
201 |
. . . .A........ |
.....G....... |
||
JPFU |
201 |
. . . .A........ |
.....G....... |
||
BG |
201 |
. . . .A........ |
.......A. .T |
||
3 |
201 |
. . . .A........ |
.......A. .T |
||
1S-C16 |
201 |
. . . .A........ |
. . .G......... |
.......A. . . |
|
N023 |
201 |
. . . .A........ |
.......A. . . |
||
1 BY |
201 |
. . . .A........ |
.......A. . . |
||
N034 |
201 |
. . . .A........ |
.......A. . . |
||
1S-c9 |
201 |
. . . .A........ |
.......A. . . |
||
NK11 |
201 |
. . . .A........ |
.......A. . . |
||
lS-clO |
201 |
. . . .A........ |
.......A. . . |
||
CRAS-1 |
201 |
.......A. . . |
|||
CRGC |
201 |
.......A. . . |
|||
CRLC-1 |
201 |
.......A. . . |
|||
PL-1238 |
201 |
____A........ |
.......A. . . |
||
151 |
201 |
... .A........ |
.......A. . . |
||
N28 |
201 |
... .A........ |
......c...... |
.......A. . . |
|
176 |
201 |
... .A........ |
......c...... |
.......A. . . |
|
12 |
201 |
... .A........ |
......c...... |
.......A. . . |
|
14 |
201 |
... .A........ |
......c...... |
.......A. . . |
|
30 |
201 |
... .A........ |
......c...... |
. .T.......... |
....C..A... |
3S |
201 |
... .A........ |
......c...... |
.......A. . . |
|
4T-cl9 |
201 |
... .A........ |
......c...... |
.......A. . . |
|
1S-C4 |
201 |
... .A........ |
......c...... |
.......A. . . |
|
NK17 |
201 |
... .A........ |
......c...... |
.......A. . . |
|
4S |
201 |
... .A........ |
......c...... |
........C. . . . |
.......A. . . |
1S-c6 |
201 |
... .A........ |
......c....c. |
.......A. . . |
|
4T-cll |
201 |
... .A........ |
......c...... |
.......A. . . |
|
N067 |
201 |
... .A........ |
......c...... |
.......A. . . |
|
lS-cl |
201 |
.... A... C ... . |
......c...... |
.......A. . . |
|
ELG Cro/08 |
201 |
... .A........ |
|||
N174 |
201 |
... .A........ |
......G. . .T |
||
Cro/VRA/09 |
201 |
... .A........ |
|||
4-6 |
201 |
... .A........ |
|||
MKC2137 |
201 |
... .A........ |
.....T....... |
???? ??? ?????? ?? ???? ?? ? ?? ???????? ? ??
Изолят BLV |
BstYIHphl |
PvuII HphI |
|||
AL-63 |
251 |
CCTGATCCCCCTCAACCCGACTTTCCCCAGTTGAACAGTGACTGGGTTCC |
|||
Cow 527 |
251 |
||||
23 |
251 |
||||
AL-2106 |
251 |
||||
UruC06II |
251 |
||||
VdM |
251 |
||||
Kurdistan |
251 |
.......А. .Т...... |
Т.....А |
А.................... |
|
AL-164 |
251 |
......С |
.т.. |
.с................... |
|
PL-4960 |
251 |
......С |
.т.. |
.с................... |
|
ARGSF8 |
251 |
....А.С |
.т.. |
.с................... |
|
AL-1453 |
251 |
......С |
.т.. |
.с................... |
|
USCA-1 |
251 |
......С |
.т.. |
||
USCA-2 |
251 |
......С |
.т.. |
||
JPFU |
251 |
......С |
.т.. |
||
BG |
251 |
......С |
.т.. |
.с................... |
|
3 |
251 |
......С |
.т.. |
.С.А................. |
|
1S-C16 |
251 |
......С |
.т.. |
.с................... |
|
N023 |
251 |
. .G.............. |
......С |
.т.. |
.с................... |
1 BY |
251 |
......С |
.т.. |
.с................... |
|
N034 |
251 |
.т.. |
.с................... |
||
1S-c9 |
251 |
......С |
.т.. |
.с................... |
|
NK11 |
251 |
......С |
.т.. |
.с................... |
|
lS-clO |
251 |
......С |
.т.. |
.С.....G............. |
|
CRAS-1 |
251 |
...........С..... |
......С |
.т.. |
.с................... |
CRGC |
251 |
...........С..... |
......С |
.т.. |
.с................... |
CRLC-1 |
251 |
...........С..... |
......с |
.т.. |
.с................... |
PL-1238 |
251 |
......с |
.т.. |
||
151 |
251 |
......с |
.т.. |
||
N28 |
251 |
......с |
.т.. |
||
176 |
251 |
......с |
.т.. |
||
12 |
251 |
......с |
.т.. |
||
14 |
251 |
......с |
.т.. |
.......G............. |
|
30 |
251 |
. .С.............. |
......с |
.т.. |
|
3S |
251 |
......с |
.т.. |
.с................... |
|
4T-cl9 |
251 |
......с |
.т.. |
||
1S-C4 |
251 |
......с |
.т.. |
||
NK17 |
251 |
......с |
.т.. |
||
4S |
251 |
.......т......... |
......с |
.т.. |
|
1S-c6 |
251 |
......с |
.т.. |
||
4T-cll |
251 |
......с |
.т.. |
||
N067 |
251 |
......с |
.т.. |
||
lS-cl |
251 |
......с |
.т.. |
||
ELG Cro/08 |
251 |
......с |
.т.. |
||
N174 |
251 |
......с |
.т.. |
||
Cro/VRA/09 |
251 |
......с |
.т.. |
||
4-6 |
251 |
......с |
.т.. |
||
MKC2137 |
251 |
......с |
.т.. |
||
? ? •к’к’к’к ?? ????? |
??? ? ?? ?? |
? ??? ????????????? |
|||
Схема 1.6. Выравнивание и рестрикционное картирование амплифицируемых |
с праймерами «епу5099» и «спу552 1» нуклеотидных последовательностей ДНК локуса епV-гена типовых изолятов известных генотипов ВЬУ [продолжение]
Изолят ВЬУ |
ЯаеШ ЯаеШЯаеШ |
|
АЬ-63 Cow 527 |
|
СТСТСТСАСАТСАТССССССТССТТТТАААТСАААСАССАССССССТТСС |
23 |
301 |
.................т................................ |
АЬ-2106 301
игиСОбИ 301
Ус1М |
301 |
||||||||
Kurdistan |
301 |
.....А. . |
|||||||
АЬ-164 |
301 |
.. .с. |
^...... |
||||||
РЬ-4960 |
301 |
.. .с. |
.в...... |
||||||
АИС5Е8 |
301 |
.. .с. |
.в...... |
||||||
АЬ-1453 |
301 |
.. .с. |
.с...... |
||||||
иЗСА-1 |
301 |
.с..с... |
|||||||
иэсд-г |
301 |
.с...... |
|||||||
JPFU |
301 |
.с...... |
|||||||
ВС |
301 |
.с...... |
|||||||
3 |
301 |
||||||||
13-С16 |
301 |
.с...... |
|||||||
N023 |
301 |
.в...... |
|||||||
1 ВУ |
301 |
.в...... |
|||||||
N034 |
301 |
.с...... |
..т.... |
||||||
13-с9 |
301 |
.................с............. |
|||||||
ЫК11 |
301 |
.................с............. |
|||||||
13-сЮ |
301 |
. .А. |
.с...... |
||||||
СКАЗ-1 |
301 |
..с... |
.с...... |
||||||
СИСС |
301 |
..с... |
.с...... |
||||||
СКЪС-1 |
301 |
....с.... |
..с.. . |
.с...... |
|||||
РЪ-1238 |
301 |
.................с............. |
|||||||
151 |
301 |
.................с............. |
|||||||
N28 |
301 |
.................с............. |
|||||||
176 |
301 |
.................с............. |
|||||||
12 |
301 |
.................с............. |
|||||||
14 |
301 |
.................с............. |
|||||||
30 |
301 |
.................с............. |
|||||||
зг |
301 |
.................с............. |
|||||||
4Т-с19 |
301 |
.................с............. |
|||||||
13-с4 |
301 |
.................с............. |
|||||||
NK17 |
301 |
.................с............. |
|||||||
43 |
301 |
.с.... |
.с...... |
||||||
13-сб |
301 |
.А. |
.с...... |
..т.... |
|||||
4Т-с11 |
301 |
.................с............. |
|||||||
N067 |
301 |
.в...... |
|||||||
13-с1 |
301 |
.в...... |
|||||||
ЕЬС Сго/08 |
301 |
... .т |
.с...... |
||||||
N174 |
301 |
.т....... |
... .т |
.с...... |
|||||
Сго/УЛА/ОЭ |
301 |
... .т |
.с.с.... |
||||||
4-6 |
301 |
... .т |
.с...... |
||||||
МКС2137 |
301 |
... .т |
.с...... |
?? ??? ?? ??????? ?? ?? ??????? ?? ? ???? ????
Изолят BLV AL-63 Cow 527 |
HaelII Sspl 351 CAGACTGTGCTATATGTTGGGAACCTTCCCCTCCCTGGGCTCCCGAAATA 351 .................................................. |
||||
23 |
351 ........... |
.......Т.......... |
|||
AL-2106 |
351 ........... |
||||
UruC06II |
351 ........... |
||||
VdM |
351 ........... |
||||
Kurdistan |
351 ........... |
||||
AL-164 |
351 ........... |
||||
PL-4960 |
351 ........... |
...............С. . |
|||
ARGSF8 |
351 ........... |
||||
AL-1453 |
351 ........... |
||||
USCA-1 |
351 ..........С |
...........G. . |
|||
USCA-2 |
351 ..........С |
...........G. . |
|||
JPFU |
351 ..........С |
...........G. . |
|||
BG |
351 ........... |
||||
3 |
351 ........... |
||||
1S-C16 |
351 ........... |
||||
N023 |
351 ........... |
||||
1 BY |
351 ........... |
||||
N034 |
351 ........... |
||||
1S-c9 |
351 ........... |
||||
NK11 |
351 ........... |
||||
lS-clO |
351 ........... |
||||
CRAS-1 |
351 ........... |
||||
CRGC |
351 ........... |
||||
CRLC-1 |
351 ........... |
. G. . . |
|||
PL-1238 |
351 ........... |
||||
151 |
351 ........... |
||||
N28 |
351 ........... |
.G. . . |
|||
176 |
351 ........... |
.G. . . |
|||
12 |
351 ........... |
.. .т.............. |
.G. . . |
||
14 |
351 ........... |
.А |
.G. . . |
||
30 |
351 ........... |
...............с.. |
.G. . . |
||
3S |
351 ........... |
.G. . . |
|||
4T-cl9 |
351 ........... |
||||
1S-C4 |
351 ........... |
.G. . . |
|||
NK17 |
351 ........... |
...............с.. |
.G. . . |
||
4S |
351 ........... |
.G. . . |
|||
1S-c6 |
351 ........... |
.G. . . |
|||
4T-cll |
351 .....С..... |
.G. . . |
|||
N067 |
351 ........... |
.G. . . |
|||
lS-cl |
351 ........... |
.G. . . |
|||
ELG Cro/08 |
351 ........... |
Т. |
|||
N174 |
351 ........... |
Т. |
|||
Cro/VRA/09 |
351 ........... |
G................. |
Т. |
||
4-6 |
351 ........... |
Т. |
|||
MKC2137 |
351 ........... |
.. .т.............. |
Т. |
||
***** **** |
*********** ** |
** *** ******* ** |
* *** |
||
Схема 1.8. Выравнивание и рестрикционное картирование амплифицируемых |
с праймерами «епу5099» и «спу552 1» нуклеотидных последовательностей ДНК локуса епV-гена типовых изолятов известных генотипов ВЬУ [продолжение]
Праймер «епу5521»
Изолят BLV AL-63 Cow 527 23 AL-2106 UruC06lI VdM Kurdistan AL-164 PL-4960 |
CCAGCTCTGGACCCGGCCTCGC
|
||||
ARGSF8 |
401 .... |
||||
AL-1453 |
401 G... |
||||
USCA-1 |
401 .... |
||||
USCA-2 |
401 .... |
||||
JPFU |
401 .... |
||||
BG |
401 .... |
.....................T. |
|||
3 |
401 .... |
..................T..T. |
|||
1S-C16 |
401 .... |
||||
N023 |
401 .... |
||||
1 BY |
401 C... |
||||
N034 |
401 .... |
||||
1S-c9 |
401 .... |
||||
NK11 |
401 .... |
||||
lS-clO |
401 .... |
.....................T. |
|||
CRAS-1 |
401 .... |
.T..... |
.....................T. |
||
CRGC |
401 .... |
.T..... |
.....................T. |
||
CRLC-1 |
401 .... |
.T..... |
.....................T. |
||
PL-1238 |
401 .... |
||||
151 |
401 .... |
||||
N28 |
401 .... |
....C. |
|||
176 |
401 .... |
....C. |
|||
12 |
401 .... |
.....................T. |
|||
14 |
401 .... |
....C. |
|||
30 |
401 .... |
.G..C. |
|||
3S |
401 .... |
....C. |
|||
4T-cl9 |
401 .... |
....C. |
.....................T. |
||
1S-c4 |
401 .... |
....C. |
.....................T. |
||
NK17 |
401 .... |
....C. |
.....................T. |
||
4S |
401 .... |
....C. |
|||
1S-c6 |
401 .... |
....C. |
.....................T. |
||
4T-cll |
401 .... |
....C. |
.....................T. |
||
N067 |
401 ____ |
....C. |
|||
lS-cl |
401 .... |
....C. |
.....................T..... |
||
ELG Cro/08 |
401 .... |
............c.............. |
|||
N174 |
401 .... |
||||
Cro/VRA/09 |
401 C... |
.....T......c.............. |
|||
4-6 |
401 .... |
||||
MKC2137 |
401 ____ |
............c.............. |
? ?? ?? ?? ?????????? ??? ?? ????? ?? ?????
Изолят BLV |
ПЦР- |
GenBank |
Генотип |
Комбинация |
|||
продукт |
A/N |
ВЬУ |
ПЦР-] |
ПДРФ-профилей |
|||
AL-63 |
444 |
bp |
FJ808571 |
генотип |
1 |
1-я : |
комбинация |
Cow 527 |
444 |
bp |
AF007764 |
генотип |
1 |
2-я : |
комбинация |
23 |
444 |
bp |
U87873 |
генотип |
1 |
3-я : |
комбинация |
AL-2106 |
444 |
bp |
FJ808578 |
генотип |
1 |
4-я : |
комбинация |
UruCO?II |
444 |
bp |
FM955558 |
генотип |
1 |
5-я : |
комбинация |
VdM |
444 |
bp |
M35239 |
генотип |
1 |
6-я : |
комбинация |
Kurdistan |
444 |
bp |
EU266062 |
генотип |
1 |
7-я : |
комбинация |
AL-164 |
444 |
bp |
FJ808574 |
генотип |
2 |
8-я : |
комбинация |
PL-4960 |
444 |
bp |
FJ808590 |
генотип |
2 |
9-я : |
комбинация |
ARGSF8 |
444 |
bp |
AF485773 |
генотип |
2 |
10-я |
комбинация |
AL-1453 |
444 |
bp |
FJ808577 |
генотип |
2 |
11-я |
комбинация |
USCA-1 |
444 |
bp |
EF065647 |
генотип |
3 |
12-я |
комбинация |
USCA-2 |
444 |
bp |
EF065648 |
генотип |
3 |
13-я |
комбинация |
JPFU |
444 |
bp |
EF065650 |
генотип |
3 |
14-я |
комбинация |
BG |
444 |
bp |
EF065638 |
генотип |
4 |
15-я |
комбинация |
3 |
444 |
bp |
U87872 |
генотип |
4 |
16-я |
комбинация |
1S-C16 |
444 |
bp |
JQ353652 |
генотип |
4 |
17-я |
комбинация |
N023 |
444 |
bp |
KC867149 |
генотип |
4 |
18-я |
комбинация |
1 BY |
444 |
bp |
HQ902258 |
генотип |
4 |
19-я |
комбинация |
N034 |
444 |
bp |
KC886611 |
генотип |
4 |
20-я |
комбинация |
1S-c9 |
444 |
bp |
JQ353640 |
генотип |
4 |
21-я |
комбинация |
NK11 |
444 |
bp |
JQ686117 |
генотип |
4 |
22-я |
комбинация |
lS-clO |
444 |
bp |
JQ353650 |
генотип |
5 |
23-я |
комбинация |
CRAS-1 |
444 |
bp |
EF065635 |
генотип |
5 |
24-я |
комбинация |
CRGC |
444 |
bp |
EF065639 |
генотип |
5 |
25-я |
комбинация |
CRLC-1 |
444 |
bp |
EF065655 |
генотип |
5 |
26-я |
комбинация |
PL-1238 |
444 |
bp |
FJ808582 |
генотип |
6 |
27-я |
комбинация |
151 |
444 |
bp |
AY185360 |
генотип |
6 |
28-я |
комбинация |
N28 |
444 |
bp |
HM102356 |
генотип |
7 |
29-я |
комбинация |
176 |
444 |
bp |
AY51527 6 |
генотип |
7 |
30-я |
комбинация |
12 |
444 |
bp |
S83530 |
генотип |
7 |
31-я |
комбинация |
14 |
444 |
bp |
AY515274 |
генотип |
7 |
32-я |
комбинация |
30 |
444 |
bp |
DQ059417 |
генотип |
7 |
33-я |
комбинация |
3S |
444 |
bp |
JF720351 |
генотип |
7 |
34-я |
комбинация |
4T-cl9 |
444 |
bp |
JQ353655 |
генотип |
7 |
35-я |
комбинация |
1S-C4 |
444 |
bp |
JQ353651 |
генотип |
7 |
36-я |
комбинация |
NK17 |
444 |
bp |
JQ686120 |
генотип |
7 |
37-я |
комбинация |
4S |
444 |
bp |
JF720352 |
генотип |
7 |
38-я |
комбинация |
1S-c6 |
444 |
bp |
JQ353633 |
генотип |
7 |
39-я |
комбинация |
4T-cll |
444 |
bp |
JQ353656 |
генотип |
7 |
40-я |
комбинация |
N067 |
444 |
bp |
KC886618 |
генотип |
7 |
41-я |
комбинация |
lS-cl |
444 |
bp |
JQ35364 9 |
генотип |
7 |
42-я |
комбинация |
ELG Cro/08 |
444 |
bp |
GU724606 |
генотип |
8 |
43-я |
комбинация |
N174 |
444 |
bp |
JF713455 |
генотип |
8 |
44-я |
комбинация |
Cro/VRA/09 |
444 |
bp |
JN990072 |
генотип |
8 |
45-я |
комбинация |
4-6 |
444 |
bp |
HM563764 |
генотип |
8 |
4 6-я |
комбинация |
MKC2137 |
444 |
bp |
JQ675759 |
генотип |
8 |
47-я |
комбинация |
Изолят BLV |
PvuII- |
Sspl- |
Hphl- |
картирование |
картирование |
рестрикционное картирование |
|
AL-63 |
1-444 |
1-399/400-444 |
1-220/221-444 |
Cow 527 |
1-444 |
1-399/400-444 |
1-220/221-444 |
23 |
1-444 |
1-399/400-444 |
1-220/221-444 |
AL-2106 |
1-444 |
1-399/400-444 |
1-220/221-444 |
UruCO?II |
1-444 |
1-399/400-444 |
1-220/221-444 |
VdM |
1-444 |
1-399/400-444 |
1-181/182-220/221-444 |
Kurdistan |
1-444 |
1-399/400-444 |
1-220/221-248/249-444 |
AL-164 |
1-280/281-444 |
1-399/400-444 |
1-220/221-444 |
PL-4960 |
1-280/281-444 |
1-399/400-444 |
1-220/221-444 |
ARGSF8 |
1-280/281-444 |
1-399/400-444 |
1-444 |
AL-1453 |
1-280/281-444 |
1-444 |
1-220/221-444 |
USCA-1 |
1-444 |
1-399/400-444 |
1-444 |
USCA-2 |
1-444 |
1-399/400-444 |
1-444 |
JPFU |
1-444 |
1-399/400-444 |
1-444 |
BG |
1-280/281-444 |
1-399/400-444 |
1-220/221-444 |
3 |
1-444 |
1-399/400-444 |
1-220/221-444 |
1S-C16 |
1-280/281-444 |
1-399/400-444 |
1-444 |
N023 |
1-280/281-444 |
1-399/400-444 |
1-220/221-444 |
1 BY |
1-280/281-444 |
1-444 |
1-220/221-444 |
N034 |
1-280/281-444 |
1-399/400-444 |
1-220/221-444 |
1S-c9 |
1-280/281-444 |
1-399/400-444 |
1-220/221-444 |
NK11 |
1-280/281-444 |
1-399/400-444 |
1-220/221-444 |
lS-clO |
1-280/281-444 |
1-399/400-444 |
1-220/221-299/300-444 |
CRAS-1 |
1-280/281-444 |
1-399/400-444 |
1-181/182-220/221-444 |
CRGC |
1-280/281-444 |
1-399/400-444 |
1-181/182-220/221-444 |
CRLC-1 |
1-280/281-444 |
1-444 |
1-181/182-220/221-444 |
PL-1238 |
1-444 |
1-399/400-444 |
1-220/221-444 |
151 |
1-444 |
1-399/400-444 |
1-220/221-444 |
N28 |
1-444 |
1-444 |
1-137/138-220/221-444 |
176 |
1-444 |
1-444 |
1-137/138-220/221-444 |
12 |
1-444 |
1-444 |
1-220/221-444 |
14 |
1-444 |
1-444 |
1-137/138-220/221-299/300-444 |
30 |
1-444 |
1-444 |
1-444 |
3S |
1-280/281-444 |
1-444 |
1-137/138-220/221-444 |
4T-cl9 |
1-444 |
1-399/400-444 |
1-137/138-220/221-444 |
1S-C4 |
1-444 |
1-444 |
1-137/138-220/221-444 |
NK17 |
1-444 |
1-444 |
1-137/138-220/221-444 |
4S |
1-444 |
1-444 |
1-137/138-220/221-444 |
1S-c6 |
1-444 |
1-444 |
1-137/138-220/221-444 |
4T-cll |
1-444 |
1-444 |
1-137/138-220/221-444 |
N067 |
1-444 |
1-444 |
1-137/138-181/182-220/221-444 |
lS-cl |
1-444 |
1-444 |
1-220/221-444 |
ELG Cro/08 |
1-444 |
1-399/400-444 |
1-220/221-444 |
N174 |
1-444 |
1-399/400-444 |
1-220/221-444 |
Cro/VRA/09 |
1-444 |
1-444 |
1-220/221-444 |
4-6 |
1-444 |
1-399/400-444 |
1-137/138-220/221-444 |
MKC2137 |
1-444 |
1-399/400-444 |
1-444 |
Изолят BLV HaelII-рестрикционное картирование
AL-63 Cow 527 23
AL-2106
UruC06II
VdM
Kurdistan
AL-164
PL-4960
ARGSF8
AL-1453
USCA-1
USCA-2
JPFU
BG
1S-C16
N023
1_BY
N034
1S-c9
NK11
1S-c10
CRAS-1
CRGC
CRLC-1
PL-1238
151
N28
- 12
- 30
- 3S
- 4T-cl9
- 1S-c4
NK17
- 4S
- 1S-c6
- 4T-cll
N067
lS-cl
ELG_Cro/08
N174
Cro/VRA/09
4-6
MKC2137
- -444
- -444
- 438/439-444
- 444
- 444
- 444
- 444
- 444
- -444
- 444
- 444
- 438/439-444
- 444
- 438/439-444
- 1-32/33-119/120-317/318-344/345-438/439-444 1-32/33-317/318-344/345-438/439-444 1-32/33-344/345-438/439-444 1-32/33-119/120-317/318-344/345-438/439 1-32/33-317/318-344/345-438/439-444 1-32/33-119/120-317/318-344/345-438/439 1-119/120-317/318-344/345-438/439-444 1-32/33-119/120-317/318-344/345-438/439 1-32/33-119/120-317/318-344/345-389/390 1-32/33-119/120-317/318-344/345-438/439 1-32/33-119/120-317/318-344/345-438/439 1-32/33-317/318-338/339-344/345-438/439 1-32/33-317/318-344/345-438/439-444 1-32/33-317/318-344/345-438/439-444 1-32/33-119/120-317/318-344/345-438/439 1-32/33-119/120-317/318-344/345-438/439 1-32/33-119/120-317/318-344/345-438/439 1-32/33-119/120-317/318-344/345-438/439 1-32/33-119/120-317/318-344/345-438/439 1-32/33-119/120-317/318-438/439-444 1-119/120-317/318-344/345-438/439-444 1-32/33-317/318-344/345-438/439-444 1-32/33-119/120-317/318-344/345-438/439 1-32/33-119/120-317/318-344/345-438/439 1-32/33-317/318-344/345-438/439-444 1-32/33-119/120-317/318-344/345-438/439 1-32/33-317/318-344/345-438/439-444 1-32/33-119/120-317/318-344/345-438/439 1-32/33-119/120-317/318-344/345-438/439 1-32/33-119/120-317/318-344/345-438/439 1-32/33-317/318-344/345-438/439-444 1-32/33-119/120-317/318-344/345-438/439 1-32/33-119/120-317/318-344/345-389/390 1-32/33-119/120-317/318-344/345-438/439 1-32/33-119/120-317/318-344/345-438/439 1-32/33-119/120-317/318-344/345-438/439 1-32/33-119/120-317/318-344/345-389/390 1-119/120-317/318-344/345-438/439-444 1-32/33-119/120-317/318-438/439-444 1-32/33-317/318-344/345-438/439-444 1-32/33-119/120-317/318-344/345-438/439-444 1-32/33-119/120-317/318-344/345-438/439-444 1-32/33-119/120-344/345-438/439-444 1-32/33-119/120-344/345-438/439-444 1-32/33-119/120-344/345-438/439-444 1-32/33-119/120-344/345-438/439-444 1-32/33-119/120-344/345-438/439-444
Изолят BLV AL-63 Cow 527 23
AL-2106
UruC06II
VdM
Kurdistan
AL-164
PL-4960
ARGSF8
AL-1453
USCA-1
USCA-2
JPFU
BG
1S-C16
N023
1_BY
N034
1S-c9
NK11
1S-c10
CRAS-1
CRGC
CRLC-1
PL-1238
151
N28
- 12
- 30
- 3S
- 4T-cl9
- 1S-c4
NK17
- 4S
- 1S-c6
- 4T-cll
N067
lS-cl
ELG_Cro/08
N174
Cro/VRA/09
4-6
MKC2137
BsfcYI-рестрикционное картирование
- 1-128/129-246/247-444
- 1-128/129-246/247-444
- 1-128/129-246/247-444
- 1-246/247-444
- 1-246/247-444
- 1-128/129-444
- 1-128/129-246/247-444
- 1-128/129-246/247-444
- 1-128/129-246/247-444
- 1-128/129-246/247-444
- 1-128/129-246/247-444
- 1-128/129-150/151-246/247-444
- 1-128/129-150/151-246/247-444
- 1-128/129-246/247-444
- 1-444
- 1-444
- 1-444
- 1-253/254-444
- 1-444
- 1-444
- 1-444
- 1-444
- 1-444
- 1-128/129-444
- 1-128/129-444
- 1-128/129-444
- 1-128/129-444
- 1-128/129-444
- 1-128/129-150/151-444
- 1-128/129-444
- 1-128/129-444
- 1-128/129-444
- 1-128/129-444
- 1-128/129-444
- 1-128/129-444
- 1-79/80-128/129-444
- 1-128/129-444
- 1-128/129-444
- 1-128/129-444
- 1-128/129-444
- 1-128/129-444
- 1-444
- 1-128/129-246/247-444
- 1-128/129-444
- 1-128/129-246/247-444
- 1-128/129-246/247-444
- 1-128/129-246/247-444
Построенная же на основании филогенетического анализа локуса е/?г-гена филограмма 47 типовых изолятов 8 известных генотипов ВЬУ, генерировавших уникальные комбинации ПЦР-ПДРФ-профилей, отражена на рис. 6.
Ш8/НМ102356/йспо1уре 7
- 14/АУ515274/ёепо1уре 7
- 176/АУ515276/йепо1уре7
;ЦР720352^спо1урс 7
- -18-с6Л0353633/еепойре 7
- -38/1Р720351/йспо1уре 7
- - 18-с4/.Г0353651 /депЫуре 7 1ЧК17/Ю686120/2епо1уре 7
- — 4Т-с 19ЛС>353655/ёепо1уре 7 4Т-с1 Ш0353656/§епо1уре 7
N067/8X886618^епо1уре 7
- 3 О/ПС? О 5 9417/йеп(Яуре 7
- 18-сШр353649^епо1урс 7 — 12/883530/дспо1урс 7
СЙ.С-1/ЕР065655^епо1уре 5
I
СЯАЗ- 1/ЕР065635/йспо1урс 5 СЯСС/ЕР065б39/ёепо1уре 5
- -РЕ-1238/Р*1808582/2епо1уре 6
- 151/АУ185360/2спо1урс 6
- - 18-с16/Ю353о52/§епо1уре 4
- - 15-сЭД0353640/2епо1уре 4
- - ЫК11/30686117/^епо1уре 4
- -15-с10А10353650/2епоГуре 4
- -N023/КС867149/еепо1уре 4
- 14034/КС886611/дакЛуре 4
- 1 ВУ/НО902258^спо1урс4
ВС/ЕР065638^епо^эе 4
_ 87872/2епо1уре 4 РЕ-4960/Р3808590/еспоТуре 2
АЬ- 1453/Р.1808577/2епо1уре 2
АЬ-164/Р3808574/жпо1уре 2
АКС8Р8/АР485773^епо1уре 2
- 8Г
- 4-6/НМ563764/ёспо1урс 8
N Г74//Г713455/{*епо1уре 8
МКС2137/Ю675759/яепо1уре 8
М/ЕЮ Сго/08/Си7246()6/цспо1урс 8
-ЕБв Сго/У11А/09/Ж9%072/«епсПуре 8
,ГРРи/ЕР()65650/«спо1урс 3
АЬ-2106/Р.1808578/йепо1уре 1 игиС06П/РМ95555
- — и8СА-1/ЕР065647/сспо1урс 3 и8СА-2/ЕР065648/йепо1уре 3
- -Кигс1Ыап/Е11266062/йепо1уре 1
Ус1М/М35239/2спо1урс 1 Cow 52 7/АР007764Л’епо1уре 1
З/йепсПуре 1
АЬ63/Р3808571/врпо1уре 1 -23/и87873/йСпо1урс 1
0.005
Рис. 6. Филограмма 47 типовых изолятов 8 известных генотипов ВБЛ, построенная на основании филогенетического анализа локуса елг-гена [МЕСА-4: алгоритм N3, 400 пр 47 scq.]
Генотипическая идентификация изолятов ВБЛ, выявленных у кр. рог. ск. в животноводческих хозяйствах ____Республики Татарстан РФ___
Г |
Изолят ВЬУ |
СепВапк Л/уУ |
ПЦР- продукт (Ьр) |
ПДРФ-фрагменты (Ьр) |
К |
Идентичные изоляты ВЬУ |
||||
Рт II |
Sspl |
НрИ |
Нае III |
|||||||
4 |
N097 |
КС886628 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
|
4 |
N025 |
КС867150 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
N026, N096 |
4 |
N069 |
КС886619 |
444 |
280.164 |
399.45 |
224.220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
N072 |
4 |
N001 |
КС867136 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
|
4 |
N002 |
КС867137 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
N004 |
4 |
N007 |
КС867141 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
|
4 |
N018 |
КС867145 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
|
4 |
N019 |
КС867146 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
|
4 |
N022 |
КС867148 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
|
4 |
N027 |
КС886607 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
N033 |
4 |
N031 |
КС886610 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
N028 |
4 |
N050 |
КС886613 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
N053, N056 |
4 |
N054 |
КС886614 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
|
4 |
N074 |
КС886620 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
N075 |
4 |
N078 |
КС886621 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
N079, N080 |
4 |
N082 |
КС886622 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
|
4 |
N084 |
КС886623 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
N086, N087 |
4 |
N090 |
КС886625 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
N110,N111,N113, N114, N124 |
4 |
N092 |
КС886626 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
N095 |
4 |
N094 |
КС886627 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
|
4 |
N100 |
КС886630 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
|
4 |
N122 |
КС886632 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
|
4 |
N123 |
КС886633 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
15 |
|
4 |
N015 |
КС867143 |
444 |
280/164 |
399/45 |
444 |
198/94/87/32/26/6 |
444 |
17 |
N016 |
Г |
Изолят BLV |
GenBank A/N |
ПЦР- продукт (Ьр) |
ПДРФ-фрагменты (Ьр) |
К |
Идентичные изоляты BLV |
||||
PvuW |
Sspl |
Hphl |
Нае III |
BstW |
||||||
4 |
N062 |
КС886615 |
444 |
280/164 |
399/45 |
444 |
198/94/87/32/26/6 |
444 |
17 |
N127-N132, N136-N140, N134 |
4 |
N023 |
КС867149 |
444 |
280.164 |
399/45 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
253/191 |
18 |
|
4 |
N029 |
КС886608 |
444 |
280/164 |
444 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
19 |
N083, N085, N091 |
4 |
N030 |
КС886609 |
444 |
280/164 |
444 |
224/220 |
198/94/87/32/27/6 |
444 |
19 |
|
4 |
N034 |
КС886611 |
444 |
280/164 |
399/45 |
224/220 |
198/121/87/32/6 |
444 |
20 |
|
7 |
N013 |
КС867142 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
294/128/22 |
29 |
N014, N057, N058, N060, N061 |
7 |
N035 |
КС886612 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
30 |
N064, N081, N108, N116,N118,N120, N125, N133 |
7 |
N003 |
КС867138 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
30 |
N008 |
7 |
N005 |
КС867139 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
30 |
|
7 |
N017 |
КС867144 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
30 |
|
7 |
N021 |
КС867147 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
30 |
|
7 |
N066 |
КС886617 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
30 |
|
7 |
N099 |
КС886629 |
444 |
444 |
444 |
224/137/83 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
30 |
N101, N102, N104-N106 |
7 |
N067 |
КС886618 |
444 |
444 |
444 |
224/137/44/39 |
198/94/87/32/27/6 |
316/128 |
41 |
|
8 |
N063 |
КС886616 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
225/94/87/32/6 |
198/128/118 |
43 |
N068 |
8 |
N006 |
КС867140 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
225/94/87/32/6 |
198/128/118 |
43 |
N009 |
8 |
N089 |
КС886624 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
225/94/87/32/6 |
198/128/118 |
43 |
|
8 |
N121 |
КС886631 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
225/94/87/32/6 |
316/128 |
44 |
|
8 |
N142 |
КС886634 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
225/94/87/32/6 |
316/128 |
44 |
|
8 |
N174 |
JF713455 |
444 |
444 |
399/45 |
224/220 |
225/94/87/32/6 |
316/128 |
44 |
N174 |
Обозначения: Г- генотип; К - комбинация ПЦР-ПДРФ-профилей.